237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1971 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 		 359 aa  734    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.01 
 
 		 365 aa  362  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1306  eIF-2B alpha/beta/delta-related protein  50.56 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0012837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.21 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.45 
 
 		 367 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.68 
 
 		 367 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.53 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.54 
 
 		 374 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.7 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  49.58 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.87 
 
 		 374 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  49.86 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.32 
 
 		 362 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  48.56 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  47.32 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.74 
 
 		 373 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.26 
 
 		 365 aa  332  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.82 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.82 
 
 		 364 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2247  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.6 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679143  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.47 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.34 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.85 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.52 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  50.76 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0641  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.55 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.43 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.97 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.83 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.87 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  43.18 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.02 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.4 
 
 		 329 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  43.66 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.12 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.32 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.32 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.7 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  42.65 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  41.71 
 
 		 350 aa  246  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  42.77 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.03 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  43.84 
 
 		 354 aa  245  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  42.18 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  44.38 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  42.49 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.79 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  42.94 
 
 		 348 aa  242  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  43.6 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  42.32 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  44.73 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.81 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.3 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.02 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  42.32 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  39.94 
 
 		 344 aa  237  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  41.36 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.81 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.38 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  42.94 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  44.57 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.01 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.22 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.98 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  42.09 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  41.18 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.7 
 
 		 349 aa  232  9e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.09 
 
 		 348 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.83 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.59 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.56 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  41.47 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.48 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1783  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.31 
 
 		 353 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  38.92 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  39.42 
 
 		 346 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.13 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  41.46 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.83 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.83 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  39.48 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.77 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  42.54 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  40.83 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  37.54 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.67 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.67 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.11 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.53 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.82 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  43.36 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  39.89 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.71 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>