233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1306 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1306  eIF-2B alpha/beta/delta-related protein  100 
 
 		 369 aa  756    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0012837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  57.89 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  55.92 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.79 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.82 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.47 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.32 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.71 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.28 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2247  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  56.94 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679143  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.27 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  57.38 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.04 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.96 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.39 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.1 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.39 
 
 		 364 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  56.27 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.39 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  52.32 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  53.28 
 
 		 365 aa  359  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.1 
 
 		 364 aa  358  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.37 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  54.64 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0641  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.42 
 
 		 365 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.64 
 
 		 370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.25 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.41 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.83 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.33 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.32 
 
 		 357 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  47.02 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  42.98 
 
 		 342 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.51 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.15 
 
 		 354 aa  255  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  44.99 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.28 
 
 		 342 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  43.3 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.18 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  47.31 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.44 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  45.56 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.02 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  42.24 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.02 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.14 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  42 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  43.02 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  43.22 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.81 
 
 		 355 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.95 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  42.61 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.29 
 
 		 338 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  42.21 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.32 
 
 		 351 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.93 
 
 		 348 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.76 
 
 		 351 aa  235  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.33 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.58 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.32 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.51 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  42.44 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  40.99 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  42.82 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.53 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.95 
 
 		 350 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.75 
 
 		 353 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.92 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  42.53 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  42.9 
 
 		 346 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  40.4 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  43.2 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.04 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.36 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.04 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.61 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  41.35 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.35 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.08 
 
 		 351 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.47 
 
 		 353 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.86 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.86 
 
 		 351 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.47 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.55 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  42.2 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.69 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  41.71 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  36.84 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  42.5 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  39.41 
 
 		 344 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  39.78 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0476  initiation factor 2B alpha/beta/delta  41 
 
 		 353 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.54 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>