243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0246 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  100 
 
 
345 aa  696    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.26 
 
 
356 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.98 
 
 
355 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.82 
 
 
343 aa  315  6e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  48.82 
 
 
343 aa  315  6e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 
351 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.88 
 
 
351 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.29 
 
 
351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.47 
 
 
353 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 
351 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 
351 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  47.32 
 
 
346 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.08 
 
 
357 aa  308  8e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.29 
 
 
353 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  49.26 
 
 
342 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  47.77 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.59 
 
 
344 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45 
 
 
349 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.59 
 
 
348 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
323 aa  299  6e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  46.78 
 
 
346 aa  298  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  46.15 
 
 
350 aa  297  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 
348 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 
348 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
321 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 
347 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  48.06 
 
 
346 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.59 
 
 
347 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.29 
 
 
348 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  47.09 
 
 
334 aa  296  4e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.48 
 
 
332 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  49.7 
 
 
321 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.73 
 
 
348 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  43.06 
 
 
358 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  46.15 
 
 
346 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.16 
 
 
349 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  49.55 
 
 
321 aa  292  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  42.43 
 
 
345 aa  292  6e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.99 
 
 
348 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.99 
 
 
348 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  49.12 
 
 
337 aa  290  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  46.18 
 
 
349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  45.87 
 
 
332 aa  289  6e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.54 
 
 
342 aa  287  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  45.72 
 
 
353 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  45.91 
 
 
349 aa  286  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.99 
 
 
354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  44.08 
 
 
346 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  47.81 
 
 
353 aa  278  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  45.03 
 
 
346 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  45.57 
 
 
350 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  46.9 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.07 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.54 
 
 
369 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.81 
 
 
350 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.24 
 
 
351 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  43.66 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.99 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  44.61 
 
 
348 aa  270  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.34 
 
 
345 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  41.44 
 
 
354 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.43 
 
 
346 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  43.24 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.34 
 
 
350 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.92 
 
 
354 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  45.13 
 
 
349 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.02 
 
 
348 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.03 
 
 
346 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  41.38 
 
 
366 aa  265  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.66 
 
 
362 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.03 
 
 
346 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  45.23 
 
 
355 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  44.21 
 
 
362 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  46.11 
 
 
338 aa  261  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  44.54 
 
 
345 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  41.06 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.07 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.44 
 
 
339 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  41.57 
 
 
372 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  45.26 
 
 
346 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.9 
 
 
353 aa  255  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.59 
 
 
354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.62 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.32 
 
 
339 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  49.53 
 
 
339 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.23 
 
 
366 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.15 
 
 
345 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  45.4 
 
 
355 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  43.47 
 
 
344 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.35 
 
 
354 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.5 
 
 
378 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  44.68 
 
 
344 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.18 
 
 
354 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.25 
 
 
347 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.07 
 
 
350 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  43.2 
 
 
350 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.2 
 
 
350 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.94 
 
 
328 aa  247  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>