235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0451 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 		 365 aa  731    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  70.41 
 
 		 367 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  67.22 
 
 		 364 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  64.46 
 
 		 365 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.01 
 
 		 374 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.01 
 
 		 374 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  63.36 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  63.64 
 
 		 367 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.74 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  65.56 
 
 		 365 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  64.74 
 
 		 373 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0641  translation initiation factor, aIF-2BI family  65.29 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  67.04 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.56 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2247  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  64.19 
 
 		 364 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679143  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  61.98 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  60.61 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  65.41 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.64 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  60.82 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.37 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  59.78 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1886  methylthioribose-1-phosphate isomerase  60.55 
 
 		 362 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.75 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1050  methylthioribose-1-phosphate isomerase  61.75 
 
 		 364 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246086  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  58.76 
 
 		 375 aa  388  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1306  eIF-2B alpha/beta/delta-related protein  56.32 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0012837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  56.44 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.01 
 
 		 359 aa  362  4e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.29 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.91 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.72 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  44.81 
 
 		 342 aa  269  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.44 
 
 		 354 aa  268  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.79 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  45.27 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  45.3 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  45.58 
 
 		 348 aa  261  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  47.92 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  44.1 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  45.33 
 
 		 346 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  43.79 
 
 		 346 aa  256  6e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.95 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.67 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.67 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  40 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  43.3 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  44.11 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  43.85 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.51 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.74 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.41 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.37 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.84 
 
 		 351 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.84 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.57 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.46 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.69 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.57 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  43.7 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  47.17 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  45.19 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.17 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.17 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  44.38 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  43.55 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  42.53 
 
 		 346 aa  238  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.33 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.35 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.33 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  40.36 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.33 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.23 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.46 
 
 		 348 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.22 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.36 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.36 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.97 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.08 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  44.79 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.05 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.67 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  43.15 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.03 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  41.53 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  43.77 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.15 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.58 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.58 
 
 		 346 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  45.18 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.4 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.82 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  42.04 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.1 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>