242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0779 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 
346 aa  711    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.59 
 
 
342 aa  358  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  56.38 
 
 
343 aa  344  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  56.38 
 
 
343 aa  344  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  54.87 
 
 
350 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  52.28 
 
 
349 aa  335  9e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.45 
 
 
344 aa  331  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  54.41 
 
 
346 aa  330  3e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.05 
 
 
354 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  47.98 
 
 
354 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  48.21 
 
 
358 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  51.9 
 
 
342 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.52 
 
 
345 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.16 
 
 
351 aa  315  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  51.17 
 
 
348 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  49.55 
 
 
346 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  48.53 
 
 
346 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  50.9 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  49.7 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.97 
 
 
348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.8 
 
 
346 aa  305  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.97 
 
 
345 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.81 
 
 
347 aa  305  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.63 
 
 
348 aa  305  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  48.8 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.51 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.52 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.51 
 
 
347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.51 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.7 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.65 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.21 
 
 
348 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.18 
 
 
347 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.41 
 
 
348 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  46.59 
 
 
355 aa  298  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.96 
 
 
339 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.18 
 
 
357 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  46.76 
 
 
349 aa  296  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  47.38 
 
 
353 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.7 
 
 
353 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 
350 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.82 
 
 
346 aa  295  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.53 
 
 
346 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.34 
 
 
329 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  48.41 
 
 
350 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.04 
 
 
337 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.94 
 
 
350 aa  292  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  48.65 
 
 
355 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.51 
 
 
349 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.96 
 
 
354 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  46.47 
 
 
345 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.23 
 
 
350 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  45.7 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.75 
 
 
351 aa  289  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.75 
 
 
351 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 
347 aa  288  9e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  50.3 
 
 
352 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.75 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.75 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.52 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  48.52 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.4 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.35 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.33 
 
 
355 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  46.85 
 
 
327 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  51.05 
 
 
344 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  49.4 
 
 
334 aa  286  5e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  43.75 
 
 
347 aa  286  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.45 
 
 
351 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.01 
 
 
362 aa  285  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.02 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.56 
 
 
328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.02 
 
 
351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.45 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.68 
 
 
353 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  49.53 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.69 
 
 
358 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  46.88 
 
 
349 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.85 
 
 
348 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  46.85 
 
 
337 aa  279  6e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  49.55 
 
 
351 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  44.28 
 
 
345 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.73 
 
 
351 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.25 
 
 
378 aa  275  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  48.15 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0476  initiation factor 2B alpha/beta/delta  43.03 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.58 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.85 
 
 
349 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  43.36 
 
 
348 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1783  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.2 
 
 
353 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  47.53 
 
 
321 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.25 
 
 
343 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.73 
 
 
354 aa  269  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.28 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.14 
 
 
369 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  45.18 
 
 
372 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  46.34 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  46.57 
 
 
348 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  46.91 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.18 
 
 
354 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>