237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0595 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 
328 aa  668    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.71 
 
 
339 aa  368  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.2 
 
 
342 aa  342  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  53.33 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  51.19 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  51.19 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
346 aa  325  9e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  50.6 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  48.1 
 
 
346 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  50.29 
 
 
342 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  47.23 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  47.25 
 
 
350 aa  307  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.76 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  46.92 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.48 
 
 
357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.22 
 
 
369 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  44.87 
 
 
346 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  45.77 
 
 
354 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.01 
 
 
329 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  53.14 
 
 
321 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.06 
 
 
344 aa  298  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  50.32 
 
 
321 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.03 
 
 
350 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.25 
 
 
354 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  45.6 
 
 
327 aa  295  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  47.95 
 
 
348 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  51.49 
 
 
321 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.17 
 
 
348 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.77 
 
 
351 aa  292  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.61 
 
 
358 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.31 
 
 
358 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  46.18 
 
 
348 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.76 
 
 
333 aa  288  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.97 
 
 
358 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.13 
 
 
378 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  47.35 
 
 
355 aa  287  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  45.89 
 
 
337 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.64 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.43 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  44.48 
 
 
344 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.66 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.37 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  48.16 
 
 
349 aa  285  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.08 
 
 
348 aa  285  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.78 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  45.56 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  45.43 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  47.78 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.08 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.56 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  47.56 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  44.04 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.34 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  48.36 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.63 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  45.35 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.95 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  44.95 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  48.9 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.78 
 
 
350 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.33 
 
 
346 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.12 
 
 
348 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.2 
 
 
348 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.2 
 
 
347 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  43.54 
 
 
355 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.91 
 
 
348 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.91 
 
 
348 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.91 
 
 
347 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.73 
 
 
350 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.92 
 
 
353 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  46.46 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  46.22 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  43.23 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  42.4 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  46.36 
 
 
332 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.16 
 
 
358 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.15 
 
 
340 aa  272  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.38 
 
 
339 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  41.98 
 
 
358 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.14 
 
 
352 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.86 
 
 
354 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.38 
 
 
339 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.38 
 
 
347 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  46.65 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  43.71 
 
 
351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.86 
 
 
354 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  45.74 
 
 
339 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  45.27 
 
 
346 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.16 
 
 
354 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.83 
 
 
350 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.9 
 
 
345 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0403  translation initiation factor 2B subunit I  42.59 
 
 
344 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.72 
 
 
353 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.89 
 
 
362 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.33 
 
 
354 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  43.2 
 
 
342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  43.25 
 
 
337 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.88 
 
 
364 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.4 
 
 
356 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.91 
 
 
358 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>