240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1052 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  100 
 
 		 321 aa  657    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  95.33 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  95.33 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  82.5 
 
 		 323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  71.86 
 
 		 337 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  51.98 
 
 		 345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  50.74 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  54.97 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  54.46 
 
 		 349 aa  308  6.999999999999999e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.19 
 
 		 342 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  51.51 
 
 		 346 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  53.35 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.29 
 
 		 378 aa  299  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.48 
 
 		 350 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  48.34 
 
 		 350 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  50.6 
 
 		 346 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.76 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.49 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.28 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  47.15 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.68 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.37 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.82 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  49.7 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  52.34 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  50.46 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  52.34 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.71 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  49.1 
 
 		 346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  46.15 
 
 		 358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.81 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.23 
 
 		 339 aa  287  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.07 
 
 		 351 aa  287  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  47.09 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  47.18 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.94 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  52.32 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.71 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  52.78 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.13 
 
 		 329 aa  281  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  49.4 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  49.4 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.26 
 
 		 354 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  47.34 
 
 		 344 aa  279  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  47.56 
 
 		 338 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  46.13 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  46.23 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.32 
 
 		 348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.1 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.02 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.85 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.99 
 
 		 356 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  47.51 
 
 		 353 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  49.7 
 
 		 345 aa  272  6e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.92 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.85 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.32 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.33 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.88 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  43.54 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  47.31 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.18 
 
 		 347 aa  268  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  47.13 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 		 348 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.88 
 
 		 348 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.92 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.44 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  42.99 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 348 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  45.37 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 349 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 349 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  46.91 
 
 		 346 aa  265  8e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  44.44 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  42.99 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.44 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  45.16 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.89 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.58 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  46.49 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  49.7 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  46.83 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.2 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.5 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.47 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.16 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  46.61 
 
 		 365 aa  255  7e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.04 
 
 		 345 aa  255  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  44.03 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.98 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.29 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>