240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2124 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 		 354 aa  716    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  98.02 
 
 		 354 aa  700    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  78.1 
 
 		 354 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  78.26 
 
 		 354 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  57.88 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  56.56 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.76 
 
 		 358 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  55.91 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  56.3 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.68 
 
 		 358 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  50 
 
 		 343 aa  328  7e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  50 
 
 		 343 aa  328  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  54.76 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.74 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.63 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  50.44 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  47.77 
 
 		 346 aa  315  7e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  56.25 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  47.79 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  47.49 
 
 		 350 aa  311  7.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.12 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  47.94 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  55.33 
 
 		 354 aa  305  7e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.75 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.06 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.51 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  47.6 
 
 		 345 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.92 
 
 		 350 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  47.49 
 
 		 346 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  50.15 
 
 		 348 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  48.48 
 
 		 344 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  50.62 
 
 		 350 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  49.43 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  51.21 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.21 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.82 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.6 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  45.88 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  46.15 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.19 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  45.95 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.57 
 
 		 350 aa  288  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  45.7 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1373  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.46 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  45.77 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.12 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.38 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  48.33 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  48.01 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.31 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.93 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1766  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 358 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.19 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.19 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  46.73 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.31 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  43.37 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.06 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  47.58 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.4 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.04 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.62 
 
 		 347 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.94 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.42 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.2 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  43.88 
 
 		 348 aa  276  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.12 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.68 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.13 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.88 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.66 
 
 		 354 aa  272  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  49.55 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  47.27 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.86 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.67 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 349 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.36 
 
 		 353 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 351 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  40.94 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  47.9 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  46.36 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  46.33 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.12 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  46.6 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.12 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.64 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  43.32 
 
 		 349 aa  259  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  44.03 
 
 		 366 aa  259  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  42.38 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.89 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  43.24 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>