239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0639 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  100 
 
 
372 aa  756    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  63.04 
 
 
364 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.2 
 
 
348 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.2 
 
 
347 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.2 
 
 
348 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.91 
 
 
348 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.62 
 
 
348 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.07 
 
 
347 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.62 
 
 
348 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.91 
 
 
348 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.62 
 
 
348 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  56.47 
 
 
354 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.75 
 
 
349 aa  358  9e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.06 
 
 
356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  52.25 
 
 
346 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  50.45 
 
 
354 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  51.05 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  55.45 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.41 
 
 
351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.41 
 
 
351 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  52.23 
 
 
350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.71 
 
 
351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.73 
 
 
353 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  52.84 
 
 
346 aa  333  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.55 
 
 
351 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.84 
 
 
351 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.3 
 
 
342 aa  332  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.26 
 
 
351 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.26 
 
 
351 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  48.34 
 
 
358 aa  332  8e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  53.03 
 
 
342 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  50.15 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.13 
 
 
349 aa  328  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.84 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.56 
 
 
355 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.54 
 
 
357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.55 
 
 
353 aa  325  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  50.15 
 
 
346 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  50.9 
 
 
343 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  50.9 
 
 
343 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.55 
 
 
346 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  50.15 
 
 
334 aa  316  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  50.3 
 
 
349 aa  316  4e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  48.2 
 
 
353 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.18 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  49.54 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.95 
 
 
346 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.95 
 
 
346 aa  305  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.97 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.51 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.25 
 
 
349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  47.6 
 
 
346 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.88 
 
 
345 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.62 
 
 
353 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  49.57 
 
 
344 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.1 
 
 
350 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.51 
 
 
337 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.84 
 
 
347 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  49.25 
 
 
355 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.07 
 
 
344 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.15 
 
 
351 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.45 
 
 
369 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  47.22 
 
 
344 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.23 
 
 
350 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.61 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.31 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  45.16 
 
 
366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  48.39 
 
 
345 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  46.11 
 
 
352 aa  285  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  44.35 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  45.18 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  46.99 
 
 
348 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.48 
 
 
345 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.18 
 
 
349 aa  279  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  41.62 
 
 
348 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  43.75 
 
 
345 aa  279  7e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.54 
 
 
358 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  40.35 
 
 
350 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.92 
 
 
349 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.92 
 
 
349 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.74 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.35 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.64 
 
 
358 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.58 
 
 
348 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  41.23 
 
 
335 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.87 
 
 
339 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.16 
 
 
339 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  41.54 
 
 
347 aa  269  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.57 
 
 
354 aa  269  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.22 
 
 
354 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  43.44 
 
 
327 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.06 
 
 
350 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.94 
 
 
358 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  45.45 
 
 
339 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.32 
 
 
329 aa  262  6.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 
365 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.44 
 
 
328 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  44.44 
 
 
365 aa  260  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  45.16 
 
 
365 aa  261  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>