238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3385 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3385  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  100 
 
 
357 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  66.86 
 
 
348 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0984  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  58.18 
 
 
343 aa  335  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  38.94 
 
 
357 aa  243  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1667  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.4 
 
 
352 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000944772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  36.07 
 
 
343 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4869  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  38.72 
 
 
359 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.06 
 
 
350 aa  169  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.1 
 
 
342 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  37.24 
 
 
337 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  33.33 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  31.4 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.02 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  33.33 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  33.84 
 
 
350 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  33.43 
 
 
354 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  33.84 
 
 
346 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.28 
 
 
354 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.22 
 
 
353 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  34.37 
 
 
334 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  33.73 
 
 
348 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.37 
 
 
332 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.61 
 
 
378 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.98 
 
 
354 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.81 
 
 
354 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  35.47 
 
 
344 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.87 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  30.95 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  36.11 
 
 
346 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.12 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  34.06 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  35.19 
 
 
350 aa  152  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.19 
 
 
350 aa  152  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.08 
 
 
345 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  32.34 
 
 
346 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.8 
 
 
354 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.45 
 
 
346 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.37 
 
 
344 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.69 
 
 
339 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.14 
 
 
357 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.14 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.69 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  35.37 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  34.36 
 
 
346 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  37.27 
 
 
339 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  34.33 
 
 
348 aa  146  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.12 
 
 
340 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  35.6 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.27 
 
 
347 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  32.72 
 
 
358 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.53 
 
 
358 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.75 
 
 
333 aa  143  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.16 
 
 
348 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.91 
 
 
365 aa  143  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.9 
 
 
345 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.72 
 
 
350 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  33.92 
 
 
354 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  37.58 
 
 
346 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.39 
 
 
358 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.01 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.31 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  30.63 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  33.13 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  32.74 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  29.75 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.44 
 
 
366 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.33 
 
 
342 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32 
 
 
348 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  30.18 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  31.06 
 
 
321 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.72 
 
 
347 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  33.63 
 
 
342 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.55 
 
 
351 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.23 
 
 
351 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.6 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.96 
 
 
354 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  35.62 
 
 
348 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.03 
 
 
348 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  34.64 
 
 
351 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.1 
 
 
348 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.55 
 
 
351 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.1 
 
 
347 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.55 
 
 
351 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.37 
 
 
351 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.1 
 
 
348 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.36 
 
 
342 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.18 
 
 
353 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.87 
 
 
358 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.15 
 
 
347 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  32.33 
 
 
349 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.25 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.65 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  31.2 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  32.82 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  31.64 
 
 
355 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.18 
 
 
349 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  33.64 
 
 
349 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.1 
 
 
348 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.74 
 
 
350 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  28.74 
 
 
337 aa  136  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>