240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0005 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  100 
 
 		 365 aa  734    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  79.06 
 
 		 366 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  82.37 
 
 		 365 aa  595  1e-169  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  78.86 
 
 		 351 aa  541  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  60.99 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.64 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  44.54 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  48.02 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  48.72 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  44.99 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  46.46 
 
 		 343 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  46.46 
 
 		 343 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  46.63 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  46.44 
 
 		 346 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.34 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  46.11 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  46 
 
 		 346 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  45.2 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  44.57 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.07 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  46.29 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.97 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  45.56 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.88 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  46.5 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.99 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  45.24 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.39 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  45.91 
 
 		 372 aa  264  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  44.21 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  44.51 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.88 
 
 		 351 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.71 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.1 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.71 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.71 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  43.02 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  43.02 
 
 		 337 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.58 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.12 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.03 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.82 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.06 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.76 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.69 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.28 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.55 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.86 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  44.64 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.69 
 
 		 353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.23 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.23 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.69 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.18 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  41.86 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.54 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  47.77 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.38 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  41.18 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.48 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.15 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.29 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.14 
 
 		 346 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  44.57 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  44.67 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.13 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.67 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.86 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  43.52 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  41.38 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.06 
 
 		 358 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  46.86 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  44.69 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.22 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  43.52 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.4 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  44.25 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  42.03 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.94 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  45.51 
 
 		 358 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.97 
 
 		 328 aa  239  8e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.94 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.48 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.88 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.21 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.44 
 
 		 353 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.3 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.48 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  43.43 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  41.88 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.54 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.42 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>