242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0921 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 		 342 aa  696    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  88.46 
 
 		 343 aa  588  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  85.29 
 
 		 342 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  84.62 
 
 		 342 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  83.04 
 
 		 342 aa  551  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  79.07 
 
 		 346 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  79.07 
 
 		 346 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  79.07 
 
 		 346 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  77.94 
 
 		 342 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.18 
 
 		 342 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  49.84 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  47.71 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.71 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.21 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  47.2 
 
 		 346 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.55 
 
 		 348 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.89 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  50 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.94 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  46.18 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  45.77 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.11 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  45.95 
 
 		 346 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  44.81 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.72 
 
 		 357 aa  268  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.01 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  42.27 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  45.4 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  43.79 
 
 		 350 aa  265  5.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  47.08 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.04 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.07 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  47.37 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.77 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.35 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.25 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.16 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  47.52 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  42.43 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  44.05 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 		 345 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  45.35 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  45.35 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.06 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.48 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  47.72 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  45.34 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  47.27 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.21 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.97 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.44 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.02 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.65 
 
 		 339 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  43.11 
 
 		 345 aa  255  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.88 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  45.02 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  47.88 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.63 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  47.4 
 
 		 348 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  50 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 356 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  46.22 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.59 
 
 		 369 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.42 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  43.71 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  47.48 
 
 		 337 aa  249  7e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.54 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0476  initiation factor 2B alpha/beta/delta  45.92 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.11 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  46.93 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.83 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.25 
 
 		 345 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.13 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  42.34 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  43.41 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.15 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  47.11 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.04 
 
 		 358 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.81 
 
 		 347 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1783  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.86 
 
 		 353 aa  241  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.38 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.09 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.73 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  41.38 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.9 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.81 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.5 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.2 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.19 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.59 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  41.07 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.77 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.69 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  42.51 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.34 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>