238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4869 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4869  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  100 
 
 
359 aa  726    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  43.4 
 
 
343 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  40.9 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  39.94 
 
 
350 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.6 
 
 
369 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  37.54 
 
 
343 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  37.54 
 
 
343 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  40.24 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3385  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  38.72 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  38.67 
 
 
337 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  36.75 
 
 
349 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.44 
 
 
356 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  38.97 
 
 
348 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  36.89 
 
 
354 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.14 
 
 
342 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.26 
 
 
357 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  40.43 
 
 
344 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.91 
 
 
344 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.14 
 
 
354 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 
355 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.95 
 
 
346 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  39.16 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  36.42 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  39.21 
 
 
346 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.31 
 
 
350 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  37.46 
 
 
346 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  36.56 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  37.61 
 
 
355 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  34.05 
 
 
357 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.31 
 
 
378 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  37.65 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.65 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.23 
 
 
350 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  37.92 
 
 
346 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.67 
 
 
333 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.32 
 
 
353 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.8 
 
 
339 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.06 
 
 
339 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  35.16 
 
 
358 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.44 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.72 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1667  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.93 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000944772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.01 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  36.8 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  36.01 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  36.56 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.65 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  37.04 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  33.64 
 
 
366 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  35.67 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.04 
 
 
346 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  35.65 
 
 
327 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  36.84 
 
 
348 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.21 
 
 
354 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.38 
 
 
365 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.21 
 
 
354 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  36.56 
 
 
321 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  38.11 
 
 
346 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  37.27 
 
 
349 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.34 
 
 
339 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0984  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  36.65 
 
 
343 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.23 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  39.65 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  34.57 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  33.33 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  36.56 
 
 
321 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.31 
 
 
347 aa  166  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.1 
 
 
356 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  37.01 
 
 
353 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  35.54 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.51 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.6 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.66 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.22 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.58 
 
 
351 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.58 
 
 
351 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.24 
 
 
358 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.58 
 
 
351 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  35.12 
 
 
337 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  31.62 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.29 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.89 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.29 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.29 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.58 
 
 
351 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.48 
 
 
351 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  33.74 
 
 
365 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.29 
 
 
348 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  33.14 
 
 
352 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.78 
 
 
339 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  35.65 
 
 
321 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.27 
 
 
351 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  34.33 
 
 
323 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.17 
 
 
351 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.17 
 
 
351 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.75 
 
 
353 aa  159  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.67 
 
 
348 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.43 
 
 
350 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.65 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.65 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>