229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2477 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  100 
 
 		 288 aa  577  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  65.12 
 
 		 283 aa  357  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  64.06 
 
 		 283 aa  352  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  53.68 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  34.18 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  33.77 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  32.16 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  29.89 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  29.21 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  36.03 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  28.47 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.72 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.82 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  27.33 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  27.45 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.04 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.43 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  26.69 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.58 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  29.08 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.91 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.24 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  27.48 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.96 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.77 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.54 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.57 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.91 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  33.69 
 
 		 505 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  27.63 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  33.15 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.95 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  31.33 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0161  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.75 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.84 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  33.12 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  30.72 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.02 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.12 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.35 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.33 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  26 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  28.2 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.44 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.14 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  23.84 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  26.58 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.41 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.74 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  27.67 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  28.57 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  31.02 
 
 		 362 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  25.09 
 
 		 349 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.81 
 
 		 358 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  29.23 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.77 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4869  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.31 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.86 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  32.03 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  22.11 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  25.17 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.5 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  23.45 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.1 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  26.24 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  33.33 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  25.16 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  31.68 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  25.16 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.22 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.61 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4407  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.91 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.791642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.03 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  33.15 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.56 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  31.37 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  28.14 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.05 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.91 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.94 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  27.91 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.91 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  33.33 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.91 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.97 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  35.34 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2386  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.61 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4697  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.44 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.293654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  30.56 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  32.65 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.1 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  32.19 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.08 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  23.53 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08600  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.71 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  28.29 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4121  aIF-2BI family translation initiation factor  30.42 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.57 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>