247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0571 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  100 
 
 
327 aa  647    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  74.19 
 
 
351 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  69.69 
 
 
331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  69.33 
 
 
323 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  44.66 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42.81 
 
 
307 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  41.21 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.16 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.69 
 
 
302 aa  232  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  42.24 
 
 
309 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  38.78 
 
 
313 aa  221  9e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  44.85 
 
 
318 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42.27 
 
 
318 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42.12 
 
 
319 aa  215  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  41.59 
 
 
331 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.44 
 
 
353 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  35.25 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  37.58 
 
 
358 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  37.83 
 
 
346 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  33.33 
 
 
342 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  36.94 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  35.29 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  35.13 
 
 
346 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  37.17 
 
 
346 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.18 
 
 
350 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  36.07 
 
 
348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  35.57 
 
 
354 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.1 
 
 
346 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  34.55 
 
 
345 aa  143  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  33.02 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.89 
 
 
348 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.07 
 
 
357 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.48 
 
 
354 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  33.55 
 
 
354 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  34.74 
 
 
346 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.67 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  36.36 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.94 
 
 
349 aa  136  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.78 
 
 
332 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.36 
 
 
362 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  33.56 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  32.45 
 
 
334 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
348 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.74 
 
 
350 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.67 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  35.78 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.36 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  34.69 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.58 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.5 
 
 
333 aa  133  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  37.83 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33 
 
 
348 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.1 
 
 
378 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  35.74 
 
 
348 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.81 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.18 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  32.78 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.93 
 
 
358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.65 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.72 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  32.56 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  33.01 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.97 
 
 
339 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  35.45 
 
 
350 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.97 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  31.49 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  32.33 
 
 
321 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.76 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  33.44 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.22 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  35.76 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.19 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.18 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  35.64 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.23 
 
 
354 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.77 
 
 
349 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  32.68 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  32.68 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.99 
 
 
342 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.57 
 
 
351 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35 
 
 
354 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  32.23 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.2 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  31.27 
 
 
347 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.24 
 
 
351 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  32.25 
 
 
344 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  35.03 
 
 
352 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.67 
 
 
339 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.24 
 
 
351 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.42 
 
 
353 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.24 
 
 
351 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.33 
 
 
345 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.08 
 
 
354 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.59 
 
 
353 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  33.87 
 
 
366 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>