239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08600  methylthioribose-1-phosphate isomerase  100 
 
 		 333 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  63.5 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  57.06 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0403  translation initiation factor 2B subunit I  51.51 
 
 		 344 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  49.1 
 
 		 346 aa  285  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  48.66 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  49.25 
 
 		 346 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.35 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  44.97 
 
 		 344 aa  279  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  52.31 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  48.04 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.15 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.65 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.9 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  46.55 
 
 		 358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.71 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.2 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  48.2 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.55 
 
 		 351 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.15 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  46.85 
 
 		 346 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.24 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  45.76 
 
 		 346 aa  266  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.71 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  44.71 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  45.35 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  44.08 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  42.34 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.66 
 
 		 342 aa  262  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  48.96 
 
 		 353 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  48.49 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.22 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  45.21 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  42.94 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.44 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.71 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.57 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  43.66 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.69 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.09 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.59 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.63 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.28 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  47.84 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  44.61 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  53.94 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  48.61 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  50.15 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  48.61 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  48.61 
 
 		 346 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.46 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  46.04 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  39.1 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.25 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.85 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.39 
 
 		 340 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.06 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.15 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.43 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  42.99 
 
 		 355 aa  248  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.22 
 
 		 342 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.95 
 
 		 346 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.36 
 
 		 365 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  47.56 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.84 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.43 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.08 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.34 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.55 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  45.35 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.53 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.55 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.88 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  45.59 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  45.18 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 351 aa  242  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.6 
 
 		 348 aa  242  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 351 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.48 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.48 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.83 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.58 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  45.62 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.38 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.74 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.67 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  44.94 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.54 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  38.21 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  44.24 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.34 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.67 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  43.99 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.24 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.55 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>