238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2541 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 		 350 aa  705    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  59.08 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  58.43 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  56.42 
 
 		 353 aa  352  5e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.29 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  52.68 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  51.62 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  47.15 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  44.61 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  44.12 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.83 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  48.39 
 
 		 353 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.61 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  46.26 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.15 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.53 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  45.43 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.65 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.53 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  48.22 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  50 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  45.32 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  43.2 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  46.85 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.18 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  47.15 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.85 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.36 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  42.9 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  43.41 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  46.42 
 
 		 348 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  46.67 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.71 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  45.71 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.63 
 
 		 369 aa  261  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  46.29 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.78 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  45.27 
 
 		 350 aa  259  7e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.73 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  42.47 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  46.33 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.16 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  43.45 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.07 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.99 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  45.7 
 
 		 343 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  45.7 
 
 		 343 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  44.12 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  45.12 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.77 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  48.2 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.77 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.51 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  45.48 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.74 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.54 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.01 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  40.99 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.8 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.32 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.12 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.84 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  43.99 
 
 		 346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  40.9 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  43.37 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.28 
 
 		 345 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.17 
 
 		 346 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.17 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.48 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  41.72 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.2 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0476  initiation factor 2B alpha/beta/delta  42.55 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  48.94 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.5 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.4 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.66 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  47.83 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  44.14 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.64 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.48 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.94 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  39.71 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  43.12 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.2 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.48 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.77 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1355  initiation factor 2B alpha/beta/delta  40.73 
 
 		 376 aa  225  8e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.232366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0701  translation initiation factor 2B subunit I  41.82 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.47 
 
 		 358 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.94 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1783  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.37 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2073  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.72 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.82 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.65 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.24 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  44.58 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.77 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>