248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2762 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  100 
 
 
331 aa  656    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  74.53 
 
 
323 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  68.24 
 
 
351 aa  418  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  69.69 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.08 
 
 
321 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.67 
 
 
307 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.3 
 
 
320 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  46.51 
 
 
309 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  42.3 
 
 
309 aa  232  8.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.54 
 
 
302 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  44.11 
 
 
318 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  40.13 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.55 
 
 
319 aa  212  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  44.02 
 
 
318 aa  209  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  42.11 
 
 
331 aa  208  9e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  38.58 
 
 
319 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  38.7 
 
 
346 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.48 
 
 
369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  38.04 
 
 
351 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  40.32 
 
 
344 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.78 
 
 
353 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  38.36 
 
 
358 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.88 
 
 
348 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  34.88 
 
 
372 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.62 
 
 
357 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.83 
 
 
347 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.81 
 
 
365 aa  143  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.26 
 
 
348 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.3 
 
 
332 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.87 
 
 
354 aa  142  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  34.18 
 
 
349 aa  142  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.18 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  38.66 
 
 
362 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.26 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.18 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.88 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  35.97 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.18 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.18 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  36.39 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.39 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  36.88 
 
 
348 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  33.33 
 
 
342 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.85 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.44 
 
 
349 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.66 
 
 
365 aa  138  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.19 
 
 
354 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.88 
 
 
354 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  35.44 
 
 
350 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  35.5 
 
 
346 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.63 
 
 
339 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  35.97 
 
 
332 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.63 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.22 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.18 
 
 
342 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  34.21 
 
 
346 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  35.67 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  36.14 
 
 
348 aa  135  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.58 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.2 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  33.9 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  36.42 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.36 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.99 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  35.55 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  35.95 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  34.97 
 
 
346 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  35.06 
 
 
349 aa  133  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  32.13 
 
 
347 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.19 
 
 
342 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  37.79 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.13 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.12 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.19 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.56 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.41 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  33.98 
 
 
343 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  33.98 
 
 
343 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.74 
 
 
358 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  37.33 
 
 
337 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.46 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  35.15 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  35.02 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  37.06 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.79 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.82 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  35.86 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  37.83 
 
 
337 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  35.46 
 
 
346 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  35.46 
 
 
346 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  35.46 
 
 
346 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.99 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.56 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.81 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  34.75 
 
 
355 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  31.1 
 
 
354 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.1 
 
 
350 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.25 
 
 
358 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.14 
 
 
358 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  34.47 
 
 
321 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>