246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0385 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  100 
 
 
319 aa  636    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  40.88 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  39.27 
 
 
318 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  47.03 
 
 
307 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  40.38 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  41.6 
 
 
309 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  41.31 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  37.5 
 
 
320 aa  175  8e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  37.45 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  37.87 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  37.92 
 
 
323 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  38.58 
 
 
331 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  37 
 
 
351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  35.25 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  36.19 
 
 
313 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  35.16 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  30.45 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  29.41 
 
 
283 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  29.19 
 
 
348 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  33.19 
 
 
312 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  36.42 
 
 
312 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  34.07 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.33 
 
 
354 aa  99.4  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  29.95 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  36.84 
 
 
342 aa  99  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.98 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  30.92 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.38 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  31.63 
 
 
385 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  37.91 
 
 
372 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.5 
 
 
354 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  32.54 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  32.06 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  32.04 
 
 
343 aa  92.4  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  32.04 
 
 
343 aa  92.4  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  29.21 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0984  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  34.41 
 
 
343 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  35.83 
 
 
346 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  33.7 
 
 
346 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  35.48 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.66 
 
 
346 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  34.95 
 
 
346 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  33.51 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.51 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  26.44 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  30.27 
 
 
489 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  30.99 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.16 
 
 
346 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.97 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.65 
 
 
354 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  30.92 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.16 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.23 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  30.92 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  30.92 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  35.23 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  30.91 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.8 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.16 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  33.7 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  36.41 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.52 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  30.4 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.15 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  30.43 
 
 
370 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.48 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.16 
 
 
351 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  33.53 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.35 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.89 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  38.38 
 
 
414 aa  86.3  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.93 
 
 
358 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  29.13 
 
 
342 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  33.33 
 
 
346 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.37 
 
 
358 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  30.81 
 
 
347 aa  85.9  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  30.7 
 
 
353 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3385  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  32.12 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  26.75 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.93 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.66 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  31.82 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  32.95 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  31.88 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  30.77 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.24 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.35 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.8 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.82 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.98 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.32 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.57 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1974  initiation factor 2 subunit family protein  34.09 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  31.61 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.52 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  33.65 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.39 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.57 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.17 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.9 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>