240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01730 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  789    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  40.32 
 
 
311 aa  179  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  31.88 
 
 
290 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  34.93 
 
 
352 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  40.52 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  28.24 
 
 
309 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.89 
 
 
321 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  38.78 
 
 
307 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  35.22 
 
 
313 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  36.05 
 
 
318 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  40.16 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  34.23 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  34.81 
 
 
320 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  36.51 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  37.12 
 
 
331 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  30.36 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  32.06 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  37.69 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.42 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  36.64 
 
 
283 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.78 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  36.69 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.17 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  37.01 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.16 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.71 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.11 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  29.92 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.11 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  28.43 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  36.51 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.62 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59263  translation initiation factor eIF2b  31.06 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  33.59 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.37 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.37 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.27 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.14 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  28.93 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.69 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.58 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  38.78 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  27.71 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.25 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.11 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.52 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  33.09 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01344  translation regulator GCD7 (AFU_orthologue; AFUA_1G09450)  25 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528894  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  25.82 
 
 
539 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  29.11 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  25.49 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  33.07 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  33.14 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  29.44 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  29.44 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.33 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  29.44 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  33.33 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  31.11 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  30.37 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.33 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  28.21 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.35 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  30.52 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.29 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.89 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  31.17 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  29.15 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  32.56 
 
 
453 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.65 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  29.09 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  28.84 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.61 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  28.74 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  28.31 
 
 
343 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2276  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  27.88 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  28.31 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.57 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.79 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.73 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.86 
 
 
353 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  30.15 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  29.61 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  28.31 
 
 
343 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  29.61 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.63 
 
 
358 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.89 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  27.88 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.17 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.88 
 
 
332 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  29.61 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.41 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  25.98 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  30.72 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.31 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  28.29 
 
 
323 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.91 
 
 
370 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.61 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  30.16 
 
 
312 aa  63.2  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  27.94 
 
 
342 aa  62.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>