158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42770 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  100 
 
 		 489 aa  979    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  32.21 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  31.78 
 
 		 326 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01390  hypothetical protein  28.73 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33562  predicted protein  26.18 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.03 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.31 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.36 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.29 
 
 		 313 aa  99  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.12 
 
 		 331 aa  96.7  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  28.24 
 
 		 309 aa  94.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.18 
 
 		 318 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.03 
 
 		 320 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.17 
 
 		 302 aa  90.9  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.89 
 
 		 318 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  30.27 
 
 		 319 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.93 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  25.83 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.51 
 
 		 323 aa  79.7  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.29 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.52 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  33.92 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  24.52 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  33.07 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  24.84 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  26.91 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  30.63 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01344  translation regulator GCD7 (AFU_orthologue; AFUA_1G09450)  27.48 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  27.72 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.72 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  28.14 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  24.81 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  26.06 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4113  aIF-2BI family translation initiation factor  31.52 
 
 		 360 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  25.46 
 
 		 346 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  25.46 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  25.91 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  24.5 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  24.44 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.22 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  30.57 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  26.54 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  30.33 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0451  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.74 
 
 		 365 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  27.84 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  24.73 
 
 		 346 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  24.07 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0360  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.98 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.26 
 
 		 345 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5890  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.73 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.365892 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  26.22 
 
 		 370 aa  55.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  26.17 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  32.33 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4832  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.37 
 
 		 364 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  21.37 
 
 		 292 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  23.83 
 
 		 345 aa  54.3  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  24.35 
 
 		 355 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  24.88 
 
 		 337 aa  53.9  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0521  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.74 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.61 
 
 		 366 aa  53.5  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.29 
 
 		 362 aa  53.5  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.09 
 
 		 347 aa  53.5  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.9 
 
 		 348 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.55 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  25.77 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  25.84 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.63 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.73 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.54 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.36 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.09 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  24.24 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  26.92 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0665  aIF-2BI family translation initiation factor  24.86 
 
 		 362 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360605  normal  0.588664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  23.93 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  24.28 
 
 		 343 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  27.04 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  23.9 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  24.88 
 
 		 365 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  26.29 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  30.12 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  24.28 
 
 		 343 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.12 
 
 		 365 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1971  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.95 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25341  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.17 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  23.78 
 
 		 349 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5307  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.81 
 
 		 374 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.5 
 
 		 351 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  27.68 
 
 		 310 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  26.29 
 
 		 321 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  27.11 
 
 		 348 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.56 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  26.14 
 
 		 288 aa  50.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  29.27 
 
 		 365 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3353  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.63 
 
 		 366 aa  50.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4936  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.49 
 
 		 373 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  24.7 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1913  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.41 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000486735  normal  0.985387 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  24.72 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  28.22 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>