247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1262 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  60.47 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  58.86 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  58.22 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  57.57 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  55.63 
 
 		 319 aa  315  5e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  58.22 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  54.97 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  53.87 
 
 		 313 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  51.69 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  50.17 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  45.69 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.54 
 
 		 331 aa  228  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  45.07 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  42.64 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  38.51 
 
 		 319 aa  185  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  38.67 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  36.67 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  36.79 
 
 		 346 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  37.92 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  37.58 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  36.79 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.01 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  40.26 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  36.79 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  38 
 
 		 346 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.38 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.33 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  38.64 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.58 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.77 
 
 		 349 aa  145  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.82 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 354 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  37.84 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  34.69 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  34.53 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  34.35 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  34.78 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  35.69 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  34.78 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.21 
 
 		 354 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.01 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  34.78 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.32 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.11 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  35.29 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  35.31 
 
 		 344 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.13 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.98 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  36.03 
 
 		 354 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.78 
 
 		 342 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  40 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  36.82 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  38.29 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.12 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  34.46 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.23 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  35.33 
 
 		 348 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  37.45 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.57 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.44 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.12 
 
 		 354 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.12 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.5 
 
 		 350 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  34.58 
 
 		 345 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.32 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  35.5 
 
 		 346 aa  135  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  38.04 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  35.23 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.81 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.71 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  35.76 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.33 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  35.55 
 
 		 345 aa  133  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  35.86 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.77 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  35.76 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.89 
 
 		 353 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  34.23 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  33.87 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  34.56 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.83 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.23 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  35.79 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.29 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  32.14 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.66 
 
 		 347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.08 
 
 		 366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  35.12 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  33.78 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.85 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.91 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.74 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.58 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>