247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0673 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  100 
 
 
313 aa  635    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  52.27 
 
 
320 aa  310  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  53.58 
 
 
307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  52.49 
 
 
321 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  55.97 
 
 
309 aa  297  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  53.9 
 
 
302 aa  293  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  50.34 
 
 
309 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  52.23 
 
 
318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  49.81 
 
 
318 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  48.01 
 
 
319 aa  259  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  49.52 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.63 
 
 
323 aa  236  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  37.77 
 
 
327 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  40.13 
 
 
331 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  36.59 
 
 
351 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  41.86 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.66 
 
 
333 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  38.91 
 
 
319 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  42.15 
 
 
355 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  39.33 
 
 
346 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.67 
 
 
349 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  37.29 
 
 
354 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  35.9 
 
 
346 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  37.97 
 
 
346 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  37.16 
 
 
346 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  37.2 
 
 
334 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.04 
 
 
332 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  34.31 
 
 
348 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.16 
 
 
369 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  39.87 
 
 
347 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  38.57 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  38.57 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  36.91 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  36.61 
 
 
346 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.39 
 
 
342 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  36.86 
 
 
332 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  37.34 
 
 
345 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.11 
 
 
354 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  33.22 
 
 
353 aa  149  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.4 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.02 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  34.64 
 
 
358 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.37 
 
 
346 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.19 
 
 
378 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  38.16 
 
 
323 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  39.46 
 
 
345 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.16 
 
 
344 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  35.23 
 
 
346 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.93 
 
 
345 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  33.89 
 
 
348 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  35.14 
 
 
352 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  33.79 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.18 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  36.82 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.11 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.02 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  34.71 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  36.39 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  33.66 
 
 
353 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  35.25 
 
 
354 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  34.23 
 
 
350 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.55 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.32 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.22 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  37.58 
 
 
337 aa  136  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  36.15 
 
 
321 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  36.27 
 
 
345 aa  135  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.41 
 
 
347 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  33.44 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  34.46 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.08 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  36.9 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.08 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.08 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.08 
 
 
348 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  32.32 
 
 
350 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.32 
 
 
350 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.18 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.9 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.34 
 
 
353 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.99 
 
 
354 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.24 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.81 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.55 
 
 
342 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.5 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.8 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.57 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.63 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  34.53 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.02 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.77 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  31.63 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.89 
 
 
365 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  34.92 
 
 
344 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  31.97 
 
 
342 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.2 
 
 
357 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  33.79 
 
 
337 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.12 
 
 
342 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.8 
 
 
362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.65 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>