234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14255 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  100 
 
 
326 aa  673    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  35.52 
 
 
539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01390  hypothetical protein  38.51 
 
 
472 aa  211  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33562  predicted protein  32.47 
 
 
505 aa  208  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884137  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  31.78 
 
 
489 aa  169  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.84 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.82 
 
 
307 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.53 
 
 
309 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  28.12 
 
 
327 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.97 
 
 
323 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.23 
 
 
313 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.52 
 
 
331 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.8 
 
 
302 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26 
 
 
321 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.35 
 
 
318 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.78 
 
 
318 aa  99.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  29.95 
 
 
319 aa  99.4  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.62 
 
 
351 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.57 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.79 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.52 
 
 
331 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  26.51 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  30.43 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  27.53 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  31.38 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  29.31 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  26.85 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  24.51 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  27.47 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.39 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.48 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  33.33 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.24 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  26.2 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  30.86 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.88 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  33.59 
 
 
386 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0775  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  28.85 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.369946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.44 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  26.07 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  25.18 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5458  predicted protein  29.09 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0354619  decreased coverage  0.00000724978 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01344  translation regulator GCD7 (AFU_orthologue; AFUA_1G09450)  26.09 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528894  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  28.14 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  26.16 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.16 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.38 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  29.34 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.88 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.13 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.91 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.79 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.1 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  24.31 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.1 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.27 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  26.54 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  32.32 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.74 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.27 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59263  translation initiation factor eIF2b  23.89 
 
 
359 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.84 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  23.21 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  29.75 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.97 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.74 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.36 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  30.43 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  26.9 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.97 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.36 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.15 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.93 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  30 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.36 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.15 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  27.39 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  26.71 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.36 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.21 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.7 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  29.52 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  27.23 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.49 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  29.55 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  28.48 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.36 
 
 
348 aa  62.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.49 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  23.66 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  23.66 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  24.15 
 
 
346 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  21.31 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.74 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.49 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  23.23 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.03 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  27.33 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  29.49 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.81 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.49 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>