88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_01344 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01344  translation regulator GCD7 (AFU_orthologue; AFUA_1G09450)  100 
 
 
433 aa  880    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528894  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59263  translation initiation factor eIF2b  40.78 
 
 
359 aa  289  8e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  33.42 
 
 
385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  32.01 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5458  predicted protein  29.18 
 
 
301 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0354619  decreased coverage  0.00000724978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.28 
 
 
321 aa  90.9  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.23 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.56 
 
 
307 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.77 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  29.25 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.58 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  23.58 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.89 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.66 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.65 
 
 
331 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.64 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  26.09 
 
 
326 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  24.61 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.17 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  27.6 
 
 
352 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  27.43 
 
 
489 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  28.51 
 
 
505 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.78 
 
 
313 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  25.79 
 
 
312 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  26.54 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.2 
 
 
353 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  28.5 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  23.85 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.75 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1373  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.6 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.43 
 
 
347 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  33.07 
 
 
345 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.15 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  20.73 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  31.34 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1357  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.8 
 
 
358 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01390  hypothetical protein  23.46 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3948  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.8 
 
 
358 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0029579  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  28.95 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  27.06 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.6 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  33.61 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  29.91 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1766  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28 
 
 
358 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  21.55 
 
 
539 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.06 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.08 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.43 
 
 
347 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.39 
 
 
351 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.58 
 
 
354 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  29.37 
 
 
352 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.41 
 
 
348 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.41 
 
 
348 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.41 
 
 
347 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.89 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.99 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.06 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.99 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04290  translation initiation factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05830)  25.69 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  9.35401e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.77 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  26.51 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.77 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.41 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  29.86 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.01 
 
 
358 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0491  translation initiation factor 2B subunit I  29.85 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  27.21 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.89 
 
 
348 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.01 
 
 
358 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  29.77 
 
 
358 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  31.25 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35743  predicted protein  33.07 
 
 
365 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.260094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  29.58 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.58 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  29.55 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  23.79 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  24.58 
 
 
337 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  32.56 
 
 
817 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  25 
 
 
332 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.08 
 
 
345 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  24.09 
 
 
345 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.57 
 
 
348 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  27.14 
 
 
344 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  28.21 
 
 
467 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.14 
 
 
353 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  29.71 
 
 
346 aa  43.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.82 
 
 
353 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>