284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23811 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  100 
 
 		 817 aa  1699    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  46.06 
 
 		 406 aa  351  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  41.09 
 
 		 423 aa  311  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  39.47 
 
 		 429 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  41.12 
 
 		 433 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35743  predicted protein  46.88 
 
 		 365 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.260094 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04290  translation initiation factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05830)  44.92 
 
 		 379 aa  281  5e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  9.35401e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  40.05 
 
 		 400 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  40 
 
 		 405 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  41.25 
 
 		 419 aa  265  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  38.86 
 
 		 400 aa  259  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  45.38 
 
 		 346 aa  259  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  41.64 
 
 		 346 aa  257  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  35.43 
 
 		 406 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  43.23 
 
 		 346 aa  255  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  37.98 
 
 		 400 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  35.81 
 
 		 419 aa  253  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  42.49 
 
 		 346 aa  253  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.31 
 
 		 342 aa  252  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  36.65 
 
 		 399 aa  252  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  37.67 
 
 		 407 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  37.8 
 
 		 400 aa  251  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  37.67 
 
 		 407 aa  251  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  40.79 
 
 		 342 aa  250  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.02 
 
 		 369 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  37.4 
 
 		 409 aa  249  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  37.4 
 
 		 396 aa  249  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.21 
 
 		 346 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.89 
 
 		 348 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  37.23 
 
 		 400 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  41.6 
 
 		 344 aa  244  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.68 
 
 		 346 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  38.02 
 
 		 393 aa  243  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  38.02 
 
 		 393 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  36.93 
 
 		 399 aa  243  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.68 
 
 		 346 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  34.55 
 
 		 420 aa  243  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  38.63 
 
 		 393 aa  243  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  41.26 
 
 		 343 aa  242  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  41.26 
 
 		 343 aa  242  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  37.74 
 
 		 393 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  37.74 
 
 		 393 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.95 
 
 		 347 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40776  predicted protein  36.32 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.838986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  37.19 
 
 		 393 aa  237  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  37.19 
 
 		 393 aa  237  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  37.36 
 
 		 393 aa  237  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.94 
 
 		 353 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  38.02 
 
 		 350 aa  236  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.37 
 
 		 350 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  36.36 
 
 		 392 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.05 
 
 		 345 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.92 
 
 		 356 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  39.71 
 
 		 348 aa  229  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  41.26 
 
 		 344 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.54 
 
 		 349 aa  229  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.96 
 
 		 354 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1783  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.55 
 
 		 353 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  40.87 
 
 		 350 aa  227  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.87 
 
 		 350 aa  227  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  36.22 
 
 		 346 aa  227  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.94 
 
 		 340 aa  227  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  36.39 
 
 		 393 aa  227  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  40.74 
 
 		 346 aa  227  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  37.47 
 
 		 393 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.59 
 
 		 354 aa  226  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  41.26 
 
 		 332 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  46.79 
 
 		 355 aa  225  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.06 
 
 		 347 aa  226  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  37.4 
 
 		 337 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  40 
 
 		 378 aa  225  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0476  initiation factor 2B alpha/beta/delta  39.83 
 
 		 353 aa  224  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  40.11 
 
 		 351 aa  224  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  37.99 
 
 		 347 aa  224  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.86 
 
 		 350 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.97 
 
 		 332 aa  224  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.96 
 
 		 357 aa  223  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  40.69 
 
 		 334 aa  223  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.54 
 
 		 358 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  37.64 
 
 		 349 aa  223  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  39.55 
 
 		 352 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02750  conserved hypothetical protein  36.93 
 
 		 393 aa  221  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.5 
 
 		 350 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 351 aa  221  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40 
 
 		 351 aa  221  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  38.94 
 
 		 354 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.22 
 
 		 350 aa  220  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0701  translation initiation factor 2B subunit I  38.03 
 
 		 354 aa  220  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.94 
 
 		 351 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  38.59 
 
 		 353 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.8 
 
 		 353 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.37 
 
 		 345 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.71 
 
 		 344 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.94 
 
 		 351 aa  220  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.78 
 
 		 339 aa  219  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  39.83 
 
 		 351 aa  220  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  41.29 
 
 		 353 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  40.46 
 
 		 358 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  37.7 
 
 		 346 aa  219  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 349 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>