53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0889 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  80.25 
 
 
400 aa  669    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  76.38 
 
 
407 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  81.5 
 
 
400 aa  676    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  76.13 
 
 
409 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  100 
 
 
400 aa  820    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  82.25 
 
 
400 aa  666    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  76.13 
 
 
407 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  75.19 
 
 
399 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  68.26 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  46.91 
 
 
396 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  45.12 
 
 
400 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  43.01 
 
 
393 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  43.01 
 
 
393 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  39.35 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  43.35 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  43.62 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  43.62 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  42.82 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  39.85 
 
 
405 aa  303  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  42.74 
 
 
393 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  43.35 
 
 
393 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  41.91 
 
 
393 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  42.55 
 
 
392 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  42.74 
 
 
393 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  41.39 
 
 
433 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  37.17 
 
 
406 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  41.29 
 
 
423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  39.67 
 
 
429 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  37.23 
 
 
817 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  36.41 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  35.83 
 
 
420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  38.33 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  34.55 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  34.55 
 
 
409 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  34.55 
 
 
409 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  34.29 
 
 
409 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  34.55 
 
 
409 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  32.67 
 
 
409 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  33.85 
 
 
409 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  33.77 
 
 
409 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  32.59 
 
 
409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  37.5 
 
 
419 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  33.33 
 
 
406 aa  215  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  34.88 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  31.35 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  32.09 
 
 
400 aa  206  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  36.34 
 
 
425 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 
358 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 
338 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  26.95 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  41.27 
 
 
120 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  24.32 
 
 
338 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  23.31 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>