54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0847 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  100 
 
 
400 aa  825    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  81.98 
 
 
396 aa  682    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  60.72 
 
 
393 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  60.72 
 
 
393 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  60.98 
 
 
393 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  60.72 
 
 
392 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  60.72 
 
 
393 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  60.47 
 
 
393 aa  471  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  60.72 
 
 
393 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  60.21 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  60.72 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  60.47 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  60.47 
 
 
393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  44.84 
 
 
400 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  46.95 
 
 
407 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  46.95 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  46.68 
 
 
409 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  45.91 
 
 
400 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  45.91 
 
 
400 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  44.42 
 
 
405 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  45.12 
 
 
400 aa  329  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  43.04 
 
 
399 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  44.83 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  40.91 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  42.01 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  42.01 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  42.01 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  42.01 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  42.01 
 
 
409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  41.73 
 
 
409 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  40.46 
 
 
409 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  41.26 
 
 
409 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  40.92 
 
 
409 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  40.1 
 
 
409 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  39.71 
 
 
423 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  40.43 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  42.29 
 
 
429 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  36.5 
 
 
420 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  40.05 
 
 
817 aa  267  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  38.87 
 
 
406 aa  263  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  36.88 
 
 
389 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  37.75 
 
 
419 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  38.69 
 
 
419 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  35.5 
 
 
408 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  33.6 
 
 
400 aa  206  7e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  34.37 
 
 
425 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  35.43 
 
 
409 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  39.29 
 
 
120 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 
338 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  25.46 
 
 
358 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  23.79 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 
341 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  21.77 
 
 
338 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  23.71 
 
 
345 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>