53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0922 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  80.25 
 
 
400 aa  669    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  100 
 
 
400 aa  822    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  82.25 
 
 
400 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  80.5 
 
 
400 aa  673    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  74.12 
 
 
407 aa  624  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  74.37 
 
 
407 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  73.87 
 
 
409 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  73.68 
 
 
399 aa  618  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  67.51 
 
 
399 aa  571  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  48.02 
 
 
396 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  44.84 
 
 
400 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  41.35 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  44.09 
 
 
393 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  43.57 
 
 
393 aa  322  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  43.57 
 
 
393 aa  322  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  43.31 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  43.57 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  43.31 
 
 
393 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  43.57 
 
 
393 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  42.78 
 
 
393 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  43.31 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  43.04 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  42.26 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  39.19 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  40.91 
 
 
433 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  39.28 
 
 
406 aa  276  6e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  38.26 
 
 
409 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  40.81 
 
 
429 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  37.87 
 
 
817 aa  252  8.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  36.46 
 
 
420 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  40.81 
 
 
423 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  35.32 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  39.37 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  35.32 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  35.07 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  35.32 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  35.07 
 
 
409 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  35.28 
 
 
409 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  33.33 
 
 
409 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  34.33 
 
 
409 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  34.47 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  39.21 
 
 
419 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  36.7 
 
 
409 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  33.94 
 
 
406 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  28.64 
 
 
408 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  30.48 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  36.15 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  28.99 
 
 
358 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  42.86 
 
 
120 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  25.86 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  24.15 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  32.99 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>