32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2030 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  58.58 
 
 		 273 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  54.78 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  52.94 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  30.33 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  32.03 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  32.29 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  32.85 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  44.12 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  31.13 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  33.9 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  30.43 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  30.3 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7793  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  28.09 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  32.99 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  28.3 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2648  aminoglycoside phosphotransferase  51.28 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.691682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  58.82 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2605  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 327 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00251914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  31.96 
 
 		 400 aa  42.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  58.82 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 340 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>