55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3317 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  78.14 
 
 		 400 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  99.75 
 
 		 409 aa  837    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  99.26 
 
 		 407 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  80.15 
 
 		 399 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  79.15 
 
 		 400 aa  663    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  100 
 
 		 407 aa  838    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  76.38 
 
 		 400 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  74.12 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  69.27 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  47.49 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  46.95 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  44.33 
 
 		 393 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  44.33 
 
 		 393 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  44.06 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  43.8 
 
 		 393 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  43.83 
 
 		 393 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  43.83 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  42.75 
 
 		 393 aa  311  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  43.24 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  39.85 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  42.56 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  43.04 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  42.74 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  37.27 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  40.26 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  41.58 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  42.31 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  42.19 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  35.2 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  37.67 
 
 		 817 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  36.58 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  40.26 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  35.4 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  35.4 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  34.77 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  35.4 
 
 		 409 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  35.4 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  34.97 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  35.4 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  34.79 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  38.66 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  33.5 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  34.3 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  31.33 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  36.94 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  31.57 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  34.89 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  25.11 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  24.43 
 
 		 338 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  24.81 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  39.68 
 
 		 120 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  23.32 
 
 		 334 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  26.5 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 243 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>