50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2612 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  100 
 
 
420 aa  861    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  38.35 
 
 
406 aa  295  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  35.04 
 
 
433 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  36.5 
 
 
400 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  37.14 
 
 
396 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  37.89 
 
 
405 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  35.02 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  37.17 
 
 
399 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  36.34 
 
 
429 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  35.2 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  35.73 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  35.63 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  35.2 
 
 
409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  35.17 
 
 
423 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  34.63 
 
 
400 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  34.74 
 
 
400 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  35.06 
 
 
393 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  36.46 
 
 
400 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  36.43 
 
 
393 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  38.36 
 
 
409 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  35.26 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  35.26 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  35.26 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  37.05 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  37.21 
 
 
409 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  35.26 
 
 
393 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  37.21 
 
 
409 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  35.83 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  37.7 
 
 
409 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  34.55 
 
 
817 aa  243  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  35.19 
 
 
393 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  37.7 
 
 
409 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  37.7 
 
 
409 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  35.18 
 
 
393 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  37.21 
 
 
409 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  34.26 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  34.76 
 
 
392 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  35.26 
 
 
393 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  36.27 
 
 
409 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  32.79 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  35.23 
 
 
409 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  30.66 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  34.81 
 
 
408 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  33.25 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  31.73 
 
 
389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  29.41 
 
 
409 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  26.14 
 
 
425 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  40.91 
 
 
120 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  22.47 
 
 
338 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0316  5-methylthioribose kinase  50 
 
 
82 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>