54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2071 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
338 aa  694    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
338 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 
334 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 
341 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  32.25 
 
 
340 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 
358 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 
343 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  23.86 
 
 
408 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  22.52 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  25.11 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  25 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  23.46 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  25 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2911  hypothetical protein  27.91 
 
 
504 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.563241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  23.75 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  25 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  24.52 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  24.43 
 
 
407 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  24.9 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  25 
 
 
400 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  24.43 
 
 
409 aa  52.8  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  23.98 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  23.11 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  23.68 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  23.35 
 
 
393 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  24.51 
 
 
393 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  24.9 
 
 
393 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  21.93 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  25.2 
 
 
429 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  24.32 
 
 
400 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  21.77 
 
 
400 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  29.41 
 
 
268 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  22.47 
 
 
420 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  23.89 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  24.79 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  22.41 
 
 
406 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  20.58 
 
 
817 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  25.79 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  19.75 
 
 
425 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 
302 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 
351 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  23.96 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  23.36 
 
 
423 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4334  aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.109272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4274  aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  22.18 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  41.67 
 
 
459 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3361  aminoglycoside phosphotransferase  25.85 
 
 
468 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4535  aminoglycoside phosphotransferase  26.62 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  44.23 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  40.43 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1516  aminoglycoside phosphotransferase  47.5 
 
 
229 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>