48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0689 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  100 
 
 
400 aa  816    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  39.05 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  36.16 
 
 
409 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  36.16 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  36.16 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  36.16 
 
 
409 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  35.66 
 
 
409 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  39.9 
 
 
408 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  35.16 
 
 
409 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  35.91 
 
 
409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  35.91 
 
 
409 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  33.92 
 
 
409 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  31.66 
 
 
409 aa  206  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  33.6 
 
 
400 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  33.51 
 
 
405 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  32.09 
 
 
400 aa  206  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  31.57 
 
 
407 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  31.57 
 
 
407 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  31.67 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  30.2 
 
 
400 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  30.63 
 
 
400 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  32.72 
 
 
396 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  31.11 
 
 
393 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  30.46 
 
 
400 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  32.39 
 
 
393 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  30.58 
 
 
399 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  31.7 
 
 
393 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  33.25 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  32.3 
 
 
393 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  31.62 
 
 
393 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  31.62 
 
 
393 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  31.52 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  31.62 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  30.75 
 
 
393 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  31.62 
 
 
393 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  31.36 
 
 
393 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  33.14 
 
 
433 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  29.2 
 
 
406 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  30.65 
 
 
406 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  30.49 
 
 
389 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  28.76 
 
 
423 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  29.61 
 
 
429 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  26.1 
 
 
425 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  29.12 
 
 
409 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  27.08 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  26.63 
 
 
419 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  27.3 
 
 
817 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  23.89 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>