49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1635 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  100 
 
 
389 aa  802    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  39.35 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  39.19 
 
 
400 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  37.53 
 
 
407 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  37.27 
 
 
407 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  37.57 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  37.01 
 
 
409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  37.47 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  37.77 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  37.84 
 
 
399 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  36.88 
 
 
400 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  37.64 
 
 
396 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  34.5 
 
 
405 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  35.67 
 
 
393 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  35.67 
 
 
393 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  35.67 
 
 
393 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  35.96 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  35.38 
 
 
393 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  35.67 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  34.58 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  35.38 
 
 
393 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  35.09 
 
 
393 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  35.09 
 
 
392 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  35.96 
 
 
393 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  31.27 
 
 
406 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  30.41 
 
 
423 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  30.13 
 
 
429 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  28.31 
 
 
419 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  29.18 
 
 
409 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  32.8 
 
 
406 aa  189  7e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  31.73 
 
 
420 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  28.39 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  28.39 
 
 
409 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  29.36 
 
 
433 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  27.71 
 
 
409 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  29.97 
 
 
817 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  27.89 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  27.39 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  27.39 
 
 
409 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  27.39 
 
 
409 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  27.39 
 
 
409 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  27.14 
 
 
409 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  29.27 
 
 
419 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  28.65 
 
 
408 aa  164  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  29.29 
 
 
409 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  30.49 
 
 
400 aa  149  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  27.09 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  21.29 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  20.25 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>