49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0407 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  100 
 
 
409 aa  825    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  37.6 
 
 
407 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  35.37 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  37.08 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  36.81 
 
 
409 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  38.86 
 
 
400 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  37.69 
 
 
400 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  34.88 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  35.96 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  36.39 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  37.14 
 
 
396 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  35.61 
 
 
400 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  34.23 
 
 
406 aa  202  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  37.23 
 
 
433 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  32.19 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  31.87 
 
 
393 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  31.87 
 
 
393 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  32.03 
 
 
405 aa  193  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  31.35 
 
 
393 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  33.05 
 
 
393 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  31.87 
 
 
393 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  31.28 
 
 
393 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  34.21 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  31.93 
 
 
817 aa  191  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  31.35 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  31.35 
 
 
393 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  35.1 
 
 
423 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  31.09 
 
 
393 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  31.59 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  29.34 
 
 
420 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  34.67 
 
 
419 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  34.77 
 
 
425 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  29.33 
 
 
389 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  29.1 
 
 
406 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  34.42 
 
 
419 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  30.62 
 
 
409 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  30.61 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  32.4 
 
 
409 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  32.4 
 
 
409 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  32.4 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  30.98 
 
 
409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  32.63 
 
 
409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  32.12 
 
 
409 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  31.84 
 
 
409 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  31.56 
 
 
409 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  29.71 
 
 
400 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  27.01 
 
 
408 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  25.21 
 
 
334 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>