55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5889 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  83.92 
 
 		 423 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  100 
 
 		 429 aa  878    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  55.74 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  54.43 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  48.26 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  39.47 
 
 		 817 aa  305  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  39.6 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  44.03 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  42.29 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  42.19 
 
 		 407 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  37.92 
 
 		 405 aa  262  8e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  42.19 
 
 		 409 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  41.76 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  41.92 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  39.73 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  36.34 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  41.55 
 
 		 399 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  41.02 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  40 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  40.83 
 
 		 393 aa  253  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  40.56 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  40.28 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  40.66 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  39.67 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  40.54 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  39.72 
 
 		 393 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  39.72 
 
 		 393 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  40 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  39.72 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  39.44 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  40 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  35.45 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  37.17 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  30.13 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  33.6 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  33.07 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  33.07 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  32.9 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  33.59 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  33.07 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  33.25 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  32.72 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  31.84 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  32.73 
 
 		 409 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  32.09 
 
 		 408 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  34.47 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  29.61 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  25.74 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  23.21 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  23.29 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  25.2 
 
 		 338 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  25.08 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  25.21 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  22.5 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 		 243 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>