50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3335 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
243 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  26.94 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 
273 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  26.23 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  28.64 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  23.77 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  28.45 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  22.82 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  21.99 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  25.41 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  23.68 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  26.32 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  27.17 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  27.08 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  24.6 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  22.04 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  23.89 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  20.25 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  22.31 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0105  aminoglycoside phosphotransferase  24.26 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0679113  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  30.21 
 
 
368 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  30.21 
 
 
368 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  27.74 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  19.19 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  23.35 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  27.78 
 
 
423 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 
338 aa  45.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  44.19 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  43.64 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4758  aminoglycoside phosphotransferase  48.65 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00571232  hitchhiker  0.000730899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  29.17 
 
 
399 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  44.74 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  29.09 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  37.5 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  27.62 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  30.56 
 
 
429 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  23.05 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  30.36 
 
 
407 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  30.36 
 
 
409 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  24.44 
 
 
409 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  27 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  44.12 
 
 
305 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  40.35 
 
 
219 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1774  hypothetical protein  26.06 
 
 
501 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  29.46 
 
 
407 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>