45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0124 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
338 aa  685    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  45.18 
 
 
358 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  44.51 
 
 
340 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
338 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 
343 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
346 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  31.18 
 
 
341 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  26.71 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  25 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  27.19 
 
 
400 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  27.51 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  27.19 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  25.67 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  25.11 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  25.11 
 
 
409 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  23.63 
 
 
393 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  25.11 
 
 
392 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  24.67 
 
 
407 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  23.63 
 
 
393 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  23.63 
 
 
393 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  25.32 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  24.47 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  24.47 
 
 
393 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  23.4 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  25.1 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  23.94 
 
 
400 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  23.45 
 
 
393 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  24.22 
 
 
419 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  23.21 
 
 
429 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  24.05 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  25.91 
 
 
419 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  23.2 
 
 
399 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  23.57 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  23.83 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  25.12 
 
 
425 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  21.29 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  23.68 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  20.45 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  30.33 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  22.55 
 
 
817 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  19.2 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0221  hypothetical protein  23.63 
 
 
398 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.676637  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0775  Fructosamine/Ketosamine-3-kinase  35.21 
 
 
266 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>