54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1742 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  81.98 
 
 
400 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  100 
 
 
396 aa  812    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  60.31 
 
 
393 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  60.1 
 
 
393 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  59.84 
 
 
392 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  60.62 
 
 
393 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  60.62 
 
 
393 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  60.1 
 
 
393 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  59.84 
 
 
393 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  59.59 
 
 
393 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  59.59 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  59.84 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  59.84 
 
 
393 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  46.31 
 
 
405 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  48.02 
 
 
400 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  47.76 
 
 
407 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  47.49 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  46.86 
 
 
409 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  48.02 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  47.37 
 
 
400 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  46.91 
 
 
400 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  47.23 
 
 
399 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  43.8 
 
 
399 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  42.75 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  41.55 
 
 
423 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  40.5 
 
 
409 aa  279  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  44.03 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  40.58 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  40.58 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  39.07 
 
 
409 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  40.32 
 
 
409 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  40.32 
 
 
409 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  39.79 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  40.51 
 
 
409 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  40.26 
 
 
409 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  39.79 
 
 
409 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  37.14 
 
 
420 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  37.89 
 
 
406 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  40.97 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  37.64 
 
 
389 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  40.16 
 
 
406 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  37.4 
 
 
817 aa  249  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  38.3 
 
 
419 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  34.45 
 
 
408 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  35.86 
 
 
425 aa  199  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  37.14 
 
 
409 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  32.72 
 
 
400 aa  193  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  25.11 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  24.81 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  23.57 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  32.61 
 
 
120 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  25.29 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  25.35 
 
 
345 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  24.26 
 
 
340 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>