51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1288 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  100 
 
 
409 aa  848    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  62.35 
 
 
409 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  62.94 
 
 
409 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  61.86 
 
 
409 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  62.19 
 
 
409 aa  534  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  62.19 
 
 
409 aa  534  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  62.69 
 
 
409 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  62.19 
 
 
409 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  61.94 
 
 
409 aa  531  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  61.44 
 
 
409 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  39 
 
 
405 aa  309  5e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  42.5 
 
 
408 aa  300  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  40.5 
 
 
396 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  39.31 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  39.58 
 
 
400 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  40.25 
 
 
393 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  40.1 
 
 
393 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  40.1 
 
 
393 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  39.84 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  39.6 
 
 
393 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  39.84 
 
 
393 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  40.26 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  38.26 
 
 
400 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  40.1 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  39.32 
 
 
392 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  36.84 
 
 
407 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  39.6 
 
 
393 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  35.48 
 
 
433 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  36.58 
 
 
407 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  36.48 
 
 
399 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  36.58 
 
 
409 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  37.77 
 
 
393 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  38.36 
 
 
420 aa  253  6e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  33.92 
 
 
399 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  36.41 
 
 
400 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  36.41 
 
 
400 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  36.41 
 
 
400 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  35.04 
 
 
406 aa  230  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  33.76 
 
 
817 aa  217  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  32.84 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  31.68 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  32.73 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  30.42 
 
 
389 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  31.77 
 
 
419 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  32.48 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  32.9 
 
 
409 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  30.03 
 
 
425 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  53.64 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0316  5-methylthioribose kinase  45.68 
 
 
82 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.329813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0441  5-methylthioribose kinase, putative  57.5 
 
 
50 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  22.27 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>