54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3299 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  95.5 
 
 		 400 aa  793    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  79.15 
 
 		 407 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  78.89 
 
 		 407 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  77.69 
 
 		 399 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  100 
 
 		 400 aa  820    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  78.89 
 
 		 409 aa  661    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  81.5 
 
 		 400 aa  676    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  80.5 
 
 		 400 aa  652    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  68.51 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  48.02 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  45.91 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  43.54 
 
 		 393 aa  322  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  43.29 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  43.04 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  43.04 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  42.78 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  42.78 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  42.53 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  43.37 
 
 		 393 aa  315  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  42.78 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  42.53 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  40.35 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  43.29 
 
 		 393 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  37.77 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  39.95 
 
 		 433 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  39.79 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  41.96 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  41.76 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  37.98 
 
 		 817 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  34.74 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  36.41 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  34.81 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  34.37 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  38.32 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  34.55 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  34.55 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  34.55 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  34.29 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  34.29 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  34.29 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  33.25 
 
 		 409 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  38.3 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  34.3 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  38.74 
 
 		 409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  30.27 
 
 		 408 aa  209  6e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  35.19 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  30.46 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  27.59 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  33.73 
 
 		 120 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 338 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  24.85 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  24.81 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0221  hypothetical protein  25.94 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.676637  normal  0.491604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>