51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0946 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  76.94 
 
 
400 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  80.4 
 
 
407 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  100 
 
 
399 aa  818    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  80.15 
 
 
407 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  79.9 
 
 
409 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  77.69 
 
 
400 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  75.19 
 
 
400 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  73.68 
 
 
400 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  68.01 
 
 
399 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  47.23 
 
 
396 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  44.83 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  44.36 
 
 
393 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  44.36 
 
 
393 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  41.6 
 
 
405 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  44.36 
 
 
393 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  44.09 
 
 
393 aa  315  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  44.09 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  44.36 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  44.09 
 
 
393 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  43.83 
 
 
393 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  43.83 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  44.06 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  41.82 
 
 
393 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  37.47 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  41.05 
 
 
406 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  40.48 
 
 
433 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  37.17 
 
 
420 aa  258  9e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  42.7 
 
 
423 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  41.55 
 
 
429 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  36.48 
 
 
409 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  36.93 
 
 
817 aa  243  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  36.01 
 
 
409 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  35.79 
 
 
409 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  35.79 
 
 
409 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  35.75 
 
 
409 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  35.68 
 
 
409 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  35.75 
 
 
409 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  39.31 
 
 
419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  35.49 
 
 
409 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  34.97 
 
 
409 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  35.29 
 
 
409 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  35.19 
 
 
406 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  36.41 
 
 
419 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  30.55 
 
 
408 aa  211  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  36.14 
 
 
409 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  31.67 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  35.32 
 
 
425 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  26.04 
 
 
358 aa  59.7  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  23.2 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  34.88 
 
 
120 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  23.96 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>