51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0520 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  100 
 
 		 419 aa  863    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  56.49 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  54.43 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  49.51 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  45.24 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  41.25 
 
 		 817 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  36.88 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  38.69 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  37.81 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  38.63 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  38.08 
 
 		 393 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  37.84 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  38.92 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  37.27 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  38.66 
 
 		 407 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  38.95 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  32.52 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  38.66 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  37.98 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  37.98 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  38.25 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  37.7 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  37.03 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  38.3 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  36.99 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  38.3 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  36.41 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  39.21 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  35.37 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  37.5 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  37.98 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  30.66 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  34.42 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  32.97 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  33.33 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  32.97 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  32.97 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  32.97 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  33.14 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  32.97 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  32.86 
 
 		 409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  32.86 
 
 		 409 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  29.27 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  34.67 
 
 		 409 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  32.29 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  27.87 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  27.08 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  24.2 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  24.14 
 
 		 340 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.436395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>