50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3248 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  100 
 
 		 425 aa  849    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  40 
 
 		 433 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  34.47 
 
 		 406 aa  249  8e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  37.34 
 
 		 423 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  36.1 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  37.17 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  34.42 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  34.55 
 
 		 817 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  34.37 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  32.98 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  32.88 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  32.8 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  34.78 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  32.97 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  33.15 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  32.97 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  35.86 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  36.34 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  33.24 
 
 		 392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  32.72 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  33.24 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  35.19 
 
 		 400 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  35.98 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  32.97 
 
 		 393 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  35.32 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  34.89 
 
 		 407 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  34.89 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  34.89 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  36.15 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  26.81 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  32.22 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  30.03 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  34.52 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  29.84 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  29.84 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  29.84 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  30.03 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  29.68 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  29.57 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  29.81 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  27.2 
 
 		 409 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  29.57 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  28.46 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  27.09 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  26.1 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  26.14 
 
 		 420 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  22.49 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  22.78 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  25.22 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  25.12 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>