54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4543 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  100 
 
 		 433 aa  877    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  48.26 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  48.76 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  45.24 
 
 		 419 aa  346  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  44.09 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  46.6 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  41.12 
 
 		 817 aa  299  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  40 
 
 		 425 aa  289  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  37.47 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  40.91 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  42.75 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  41.39 
 
 		 400 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  36.21 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  40.91 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  40.48 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  41.84 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  40.11 
 
 		 393 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  41.58 
 
 		 407 aa  273  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  39.95 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  41.58 
 
 		 409 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  35.04 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  39.05 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  39.95 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  40.22 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  39.94 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  39.94 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  39.94 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  39.94 
 
 		 393 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  39.68 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  39.94 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  39.67 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  39.67 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  39.94 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  35.48 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  35.56 
 
 		 409 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  35.29 
 
 		 409 aa  239  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  35.29 
 
 		 409 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  35.29 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  34.52 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  35.03 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  35.03 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  34.76 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  34.76 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  36.7 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  28.53 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  29.36 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  33.14 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  27.51 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  26.56 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  25.55 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  23.69 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  25.75 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0442  5-methylthioribose kinase, putative  26.23 
 
 		 120 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  26.13 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>