52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0964 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  100 
 
 
419 aa  836    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  55.74 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  55.9 
 
 
423 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  49.51 
 
 
419 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  47.1 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  38.08 
 
 
406 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  37.75 
 
 
400 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  39.53 
 
 
399 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  40.97 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  40.53 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2732  methylthioribose kinase  38.29 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000673145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  40.26 
 
 
407 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  35.92 
 
 
817 aa  253  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  40.26 
 
 
409 aa  252  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  37.99 
 
 
393 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4140  methylthioribose kinase  38.44 
 
 
393 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0459885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4252  methylthioribose kinase  37.99 
 
 
393 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3943  methylthioribose kinase  37.99 
 
 
393 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00983764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3790  methylthioribose kinase  37.99 
 
 
393 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4099  methylthioribose kinase  37.71 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.809663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3862  methylthioribose kinase  37.43 
 
 
392 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4160  methylthioribose kinase  37.15 
 
 
393 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0852647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  39.06 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  38.58 
 
 
400 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4054  methylthioribose kinase  38.27 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3775  methylthioribose kinase  37.15 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  38.32 
 
 
400 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0946  methylthioribose kinase  39.31 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  38.61 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2612  5-methylthioribose kinase  32.79 
 
 
420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.122259  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  32.64 
 
 
405 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  36.34 
 
 
425 aa  223  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1972  methylthioribose kinase  32.93 
 
 
406 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1635  methylthioribose kinase  28.31 
 
 
389 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4925  5-methylribose kinase  35.47 
 
 
409 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.304411  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0346  5-methylribose kinase  34.22 
 
 
409 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0331  5-methylribose kinase  34.22 
 
 
409 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0326  5-methylribose kinase  33.51 
 
 
409 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0318  5-methylribose kinase  34.22 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0378  5-methylribose kinase  34.22 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0440  5-methylribose kinase  33.69 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0315  5-methylribose kinase  33.69 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0393  5-methylribose kinase  34.71 
 
 
409 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1288  5-methylribose kinase  31.41 
 
 
409 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0776  5-methylthioribose kinase  28.77 
 
 
408 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.498947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  34.92 
 
 
409 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0689  methylthioribose kinase  27.08 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.893239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  28.32 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  30.83 
 
 
346 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 
338 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>