32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1765 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
340 aa  667    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  48.92 
 
 
358 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  44.51 
 
 
338 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  48.94 
 
 
334 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  32.25 
 
 
338 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  37.01 
 
 
343 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  38.83 
 
 
346 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 
341 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0889  methylthioribose kinase  26.95 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  25.55 
 
 
433 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  25.15 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  24.85 
 
 
400 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  23.87 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  22.03 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  25.21 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  24.14 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  24.39 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
303 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  27.59 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  24.55 
 
 
399 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  26.5 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0922  methylthioribose kinase  25.86 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  26.5 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  26.5 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3361  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 
468 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2431  hypothetical protein  31.62 
 
 
434 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  24.26 
 
 
396 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5580  aminoglycoside phosphotransferase  26.4 
 
 
345 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0327  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
274 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  51.35 
 
 
273 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>