45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0625 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  690    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  33.55 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  32.39 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  31.45 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  32.12 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  34.47 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  30.63 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  30.63 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  30.63 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  30.06 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  30.62 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  31.05 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  29.79 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  32.63 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  32.63 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  32.63 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  43.3 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  29.14 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  28.42 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  27.97 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  27.88 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  27.7 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  27.08 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  30.19 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  26.76 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  25.85 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  28.36 
 
 		 678 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  27.5 
 
 		 661 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  27.4 
 
 		 667 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1662  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.119622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  29.77 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  29.46 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0265  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.702133  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1431  fructosamine kinase  28.57 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0847  methylthioribose kinase  23.71 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000330534  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 590 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1742  methylthioribose kinase  25.35 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2807  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>