141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01390 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG01390  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  959    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06864  translation initiation factor eif-2b delta subunit (AFU_orthologue; AFUA_5G13040)  39.59 
 
 
539 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0293863 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33562  predicted protein  33.5 
 
 
505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.884137  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  38.51 
 
 
326 aa  223  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42770  predicted protein  31.04 
 
 
489 aa  163  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00451975  normal  0.119284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  29.23 
 
 
309 aa  96.3  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.08 
 
 
320 aa  90.5  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.19 
 
 
309 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.29 
 
 
318 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  25.81 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.5 
 
 
302 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  23.87 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.66 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.48 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  23.87 
 
 
321 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.19 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.37 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  25.83 
 
 
327 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.48 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  23.34 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  26.1 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  28.44 
 
 
292 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  27.73 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  27.97 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  27.76 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  23.13 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  31.88 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  28.44 
 
 
320 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06080  eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2, putative  30 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  27.96 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  27.85 
 
 
290 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  29.7 
 
 
311 aa  63.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21290  predicted protein  24.68 
 
 
385 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  27.15 
 
 
347 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  29.44 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  28 
 
 
323 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.77 
 
 
357 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.79 
 
 
342 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  27.44 
 
 
349 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  24.19 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  23.34 
 
 
358 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.88 
 
 
344 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01344  translation regulator GCD7 (AFU_orthologue; AFUA_1G09450)  24.49 
 
 
433 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.528894  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.78 
 
 
353 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.12 
 
 
349 aa  53.5  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.34 
 
 
345 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  25.27 
 
 
354 aa  53.5  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.71 
 
 
351 aa  53.5  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.15 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.79 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  24.26 
 
 
349 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  25.08 
 
 
345 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  24.88 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.57 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  27.11 
 
 
353 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  24.63 
 
 
321 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  24.63 
 
 
321 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.68 
 
 
350 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  28.66 
 
 
344 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  28.12 
 
 
351 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  25.48 
 
 
312 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  28.4 
 
 
338 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  26.36 
 
 
342 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1140  translation initiation factor 2B subunit I  25 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  23.98 
 
 
355 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.06 
 
 
329 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  28.05 
 
 
467 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.83 
 
 
342 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0770  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.35 
 
 
366 aa  50.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.301181  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  24.14 
 
 
321 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02750  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
393 aa  50.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0396  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.39 
 
 
370 aa  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.359627  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.83 
 
 
342 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.88 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.49 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.25 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.53 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  28.64 
 
 
283 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  26.67 
 
 
327 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  24.68 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  24.68 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  24.68 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  27.33 
 
 
353 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  25.56 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.98 
 
 
349 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.98 
 
 
349 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.3 
 
 
343 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  23.83 
 
 
342 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  26.85 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.54 
 
 
354 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  25.44 
 
 
349 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  26.88 
 
 
346 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  27.23 
 
 
346 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.3 
 
 
338 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.66 
 
 
350 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.09 
 
 
358 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  26.25 
 
 
342 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  23.17 
 
 
350 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  26.25 
 
 
344 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  24.1 
 
 
354 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>